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« Nos animaux familiers sont des anges déguisés venus sur terre pour nous apprendre la douceur. »

Simonetta Greggio

LE SAUVETAGE GÉNÉTIQUE / OUTCROSS

 

 

 

LE SAUVETAGE GÉNÉTIQUE / OUTCROSS

     

    Introduction :

     

    L’augmentation de la diversité génétique de populations consanguines par l’introduction de nouveaux individus est souvent appelée « sauvetage génétique ». Les décisions de sélection de conservation pour le (généralement) petit nombre d’individus croisés sont essentielles à la gestion du processus de sauvetage, et nous pouvons nomme R1O (race 1 d’origine ), R1E (race 1 Exterieur), leurs croisements (F1) et rétrocroisements de première génération avec la Race 2 externe (F2) avec plus de 170 000 loci de polymorphisme nucléotidique unique pour comparer leurs niveaux de diversité génétique. Nous avions prédit que la diversité du génome chez les chiens F2 serait plus élevée que chez la race d’origine mais inférieure à celle du F1, et les valeurs d’hétérozygotie montraient les tendances attendues.

    Nous avons également constaté que les séries d’homozygotie, régions chromosomiques étendues de génotypes homozygotes héritées d’un ancêtre commun, étaient réduites chez les individus F2 par rapport aux individus de la Race d’origine. Nos analyses démontrent les avantages du croisement mais indiquent qu’une partie de la diversité génétique acquise est perdue suite au rétrocroisement immédiat. Des croisements supplémentaires entre croisements F2 pourraient donc mériter une attention plus approfondie dans la gestion du sauvetage génétique.

     

    Une race fortement consanguine va manifester des signes de dépression de consanguinité par une fertilité réduite due à la petite taille des portées, des problèmes de comportement d’accouplement (probablement dus à des mécanismes d’évitement de la consanguinité) et une faible qualité du sperme. De plus, beaucoup de races comme le berger allemand ont une prédisposition à développer des pathologies intestinales, une entéropathie avec perte de protéines qui peut provoquer des symptômes tels qu’une diarrhée intermittente, des vomissements, une perte de poids ….Pour cette raison, les éleveurs informent les futurs propriétaires des symptômes potentiels qui pourraient survenir et nécessiter un traitement vétérinaire immédiat. Le mode de transmission des affections gastro-intestinales n’est pas bien compris et pourrait, au moins en partie, s’expliquer par une transmission polygénique et une fréquence élevée – ou fixation – du ou des gènes responsables.

     

    1. La mise en place d’un projet out-cross :
    Afin que la variabilité génétique soit conséquente et que le bénéfice du croisement ne soit pas perdu en F2. Il est important de sélectionner 3 races candidates au croisement sur les bases suivantes : les traits physiques et comportementaux ; l’histoire commune ; la distance génétique.
    Le plan est de conserver les croisements avec ces trois races comme trois lignées distinctes avec leur propre stud-book et de les suivre pendant plusieurs générations en les croisant entre elles avant d’envisager leur inclusion dans la population de la race d’origine et de les enregistrer dans le stud-book de la race principale. Tous les croisements sont évalués pour leur bonne santé, leur morphologie et leur comportement à l’âge de deux ans. A ce stade du projet Outcross, les critères d’inclusion en élevage reposent uniquement sur la santé et le comportement et non sur l’apparence extérieure.
    Il est également important de conserver au moins 1 fils et 1 fille de chacun de ces croisements et rétro croisement afin de stabiliser la balance entre les lignées des pères et des mères. Et ne pas construire par saturation des lignées uniques de pères et des lignées unique de mères comme l’ont trouvé actuellement.

     

    2. L’exemple du Lundehund :
    Dans le projet Outcross du Lundehund, les croisements de deuxième génération produits par le projet montrent tous les traits spécifiques, tels que la polydactylie, les oreilles pliables et la flexibilité des articulations, alors qu’il existe encore une variation morphologique relativement importante en termes de taille, de structure osseuse et de forme des oreilles. Cette variation serait plutôt normale chez d’autres races de chiens avec un pool génétique plus diversifié, mais avec leur variation génétique réduite, les individus Lundehund ont tendance à présenter une très faible variation morphologique. À ce jour, aucun des individus F1 et F2 n’a montré de signes de développement du Lundehund Syndrome (gastro enteropathie), même s’il convient de souligner que les individus F2 les plus âgés n’ont que cinq ans et que le succès du projet de consanguinité devrait être évalué à plus long terme. Pour les neuf portées d’individus F2 produites à ce jour, la taille moyenne des portées était = 4,2 et la médiane était = 5, tandis que pour le Lundehund, les tailles moyenne et médiane des portées étaient = 3.

     

    3. Conclusion :
    Cette étude sur le Lundehund documente clairement l’effet génétique bénéfique du croisement avec une population de chiens hautement consanguins. Il montre également que le rétrocroisement de la génération F1 avec la population parentale entraîne une perte d’une partie de l’hétérozygotie souhaitée obtenue lors du croisement initial.
    Pour préserver les caractéristiques du Lundehund, les chiens F2 ont été réalisés en croisant le F1 avec le Lundehund et non avec d’autres chiens F2 de lignées différentes. Alors que le rétrocroisement ultérieur du F1 avec le Buhund (Race Extérieure) aurait produit une génération F2 avec des niveaux d’hétérozygotie plus élevés que ceux obtenus par le croisement F1 × Lundehund, cette étude quantifie l’effet de la stratégie de rétrocroisement immédiat sur la diversité génétique.
    Cela nous amène a une ligne de conduite afin d’effectuer un programme de sauvetage génétique et d’amélioration de la santé d’une race sur des critères spécifiques et de sélection réfléchie.

     

    Un programme Outcross ne se fonde pas au hasard et sans réelle connaissances de la génétique et ne s’effectue pas en 1 seul croisement !

     


    Mais il se construit sur la durée, le suivi et s’inscrit dans le temps

     

     

     

    Sources :